چه کرامتی از این بالاتر ؟
شخصی از آیت الله مروارید پرسید : شما این همه مدت که در جوار حضرت رضا (ع) بوده اید کرامتی هم از حضرت رضا (ع) دیده اید که برای ما نقل کنید ؟ ایشان بلافاصله فرمودند : چه کرامتی از این بالاتر که من هر چه دارم ، از حضرت رضا (ع) دارم !...

امروز بیدارم نکردند !
در ایام نوجوانی ، یک روز صبح وقتی به حجره ام در مدرسه رفتم ، هم حجره ای ام به من گفت : حاج آقا آمده بودند اینجا و گفتند به تو بگویم که امروز مکلف شده ای ! در فکر فرو رفتم و با خود گفتم چند سال است که حاج آقا صبح ها مرا برای نماز بیدار می کردند و با خودشان به حرم می بردند ولی امروز بیدارم نکردند ...

مجلس درس و توسل
شاگردانشان نقل می کردند : بارها شده بود که جلسه درس آیت الله مروارید به مجلس دعا و توسل ختم می گشت ...

برکت حرم
از حاج آقا پرسیده بودند : این فرزندان صالح به واسطه چه چیزی نصیب شما شده است ؟ فرموده بودند : از برکت حرم رفتن صبحهاست ...

رویت هلال ماه
حاج آقا جلال مروارید نقل می کنند : شب اول ماه شوال ، با اخوی (آیت الله مروارید) به مسجد گوهرشاد رفتیم و در یکی از شبستان ها کنار ایشان مشغول نماز شب عید فطر شدیم . در اثنای نماز ، شخصی می آمد و می رفت و گویا منتظر بود نماز اخوی تمام شود . وقتی دید نماز طول می کشد به ایشان گفت : آیت الله العظمی بروجردی به همراه آیت الله حاج شیخ علی اکبر نوغانی در ایوان مقصوره منتظر شما هستند . اخوی نماز را سلام داد و با هم نزد آیت الله العظمی بروجردی رفتیم . مردم در محضر ایشان منتظر ثبوت رویت هلال ماه شوال برای معظم له بودند . آیت الله العظمی بروجردی از اخوی پرسیدند : شما ماه را دیده اید ؟ اخوی پاسخ دادند : بله ! آیت الله العظمی بروجردی بی درنگ و بدون سوال از محل ، زاویه و کیفیت رویت رو به مردم فرمودند : الحمدلله فردا عید است ! مردم نیز با خوشحالی صلوات فرستادند .

از مدرک نپرس !
حجت الاسلام والمسلمین راشد یزدی نقل می کنند : در یکی از دیدارهای آیت الله مروارید با رهبر معظم انقلاب که بنده نیز توفیق حضور داشتم ، رهبر معظم از ایشان دعایی درخواست نمودند . آیت الله مروارید نیز دعایی را برای ایشان خواندند . بنده نیز که آن دعا را برای خود یادداشت می کردم ، عرض کردم : مدرک دعا را نیز بفرمایید تا زیر آن یادداشت کنم . بلافاصله حضرت آیت الله خامنه ای فرمودند : بنویسید آیت الله مروارید !

اتفاق خاصی نیست !
در کتمان برخی حالات و مکاشفات ، سعی وافر داشتند . در جریان یک مکاشفه چند ساعته که به سبب تغییر حالت چشم و خطوط چهره ، برخی از اطرافیان متوجه شده بودند ، به سادگی و با لبخند می فرمودند : اینها چیز فوق العاده یا تازه ای نیست ! خداوند برای خیلی از بندگان خود چنین لطف هایی دارد ، اتفاق خاصی نیست ...

امام جماعت
روزی تعدادی از علما و روحانیون مازندران در یکی از اتاق های مدرسه بودند ، وقتی ظهر شد طلبه ها به آیت الله العظمی کوهستانی گفتند جلو بایستید تا نماز را به شما اقتدا کنیم . ایشان نگاهی به علما که آیات میرزا جوادآقا تهرانی ، صدرزاده ، دامغانی و شاهرودی بودند کردند و بعد فرمودند : آن آقا نماز بخواند و به آیت الله مروارید اشاره کردند با اینکه شاید آن زمان ایشان را نمی شناختند .

کمک آبرومندانه
یکی از فضلا و روحانیون مشهد نقل کردند : اوایلی که به مشهد منتقل شدم با کسی آشنا نبودم و در منطقه ای خانه ای اجاره کردم . آن زمان شرایط مالی مناسبی نداشتم . روزی که برای پرداخت اجاره ماهانه نزد صاحب خانه رفتم با کمال تعجب صاحب خانه ام گفت : شخصی اجاره شما را تا یکسال پرداخت کرده است و من که حیران مانده بودم ، مدت ها بعد فهمیدم که آن شخص آیت الله مروارید بوده است .

احترام آیت الله سیستانی
حضرت آیت الله مروارید در آخرین سفر زیارت عتبات عالیات سال 1377 شمسی به همراه چند تن از نزدیکانشان برای دیدار با حضرت آیت الله سیستانی به منزل ایشان رفتند . با ورود آیت الله مروارید ، آیت الله سیستانی برای استقبال ایشان به صحن حیاط آمدند و بعد از عرض سلام ، دست ایشان را بوسیدند و خودشان به جای یکی از جوان ها ، زیر بغل ایشان را گرفتند . آیت الله مروارید در آن ایام که دیگر چشمشان نمی دید پرسیدند : ایشان کیست ؟ آیت الله سیستانی خود پاسخ دادند : منم علی !
( به نقل از کتاب مروارید علم و عمل ، نوشته محمد الهی خراسانی )